Штамм это популяция бактерий, вирусов или иных микроорганизмов одного вида, взятая в одном конкретном месте. Эта популяция, как правило, имеет схожие биохимические и генетические признаки, и если проводить аналогии с человечеством, то можно считать штамм вируса «нацией» или «расой».
Немецкое слово Stamm переводится как «ствол», поэтому штаммы можно считать изолированными «ответвлениями» одного и того же вида микробов. По штамму вируса можно понять, где человек его подхватил, и тем самым проследить цепочку заражений для выявления очагов и назначения терапии.